Wilayah Puskesmas Pati II meliputi 12 desa, yaitu
1. Desa Kutoharjo
2. Desa Mulyoharjo
3. Desa Ngepungrejo
4. Desa Payang
5. Desa Purworejo
6. Desa Sarirejo
7. Desa Sidokerto
8. Desa Sinoman
9. Desa Sugiharjo
10. Desa Tambaharjo
11. Desa Tambahsari
12. Desa Widorokandang